2001年6月，“中心”与美国霍普金斯大学《思想家》杂志社合作，在南大召开了《思想家》杂志“第二届思想史（中国思想史）国际学术讨论会”，16位外国学者和来自南大、北大、清华、复旦、上海社科院的20余位国内学者围绕思想史研究的对象与范围、不同领域和学科在思想史发展中的地位、联系等问题进行了深入的交流，共涉及哲学、政治学、图书社会史、女性与性别研究和中国近代思想史五个方面的内容。
“中心”组织了论文12篇参加会议，并有6位学者做了大会发言。这次会议对于海内外中国思想史的深入研究起到了有益的促进作用。会议的部分论文（中文）由“中心”收入《中国学术与中国思想史》一书。